Clownhouse suit l'histoire du principal protagoniste Casey, un enfant normal dont la vie est constamment influencée par sa crainte intense des clowns et ses deux frères, Geoffrey et Randy. Pendant une nuit, les trois garçons sont laissés seuls et décident de visiter un cirque local en dépit de la phobie de Casey. Pendant ce temps, trois patients fou se sont échappés d'un asile et leur premier arrêt est le cirque.